Lãnh đạo viện 01: Viện Trưởng: Đặng Kim Sơn 02: Phó Viện Trưởng: Nguyễn Đình Long 03: Phó Viện Trưởng: Dương Ngọc Thí Phòng Khoa học 04: Quyền Trưởng phòng: Phạm Đức Minh 05: Phó Trưởng phòng: Trần Thị Quỳnh Chi Phòng tài chính 06: Kế toán trưởng: Nguyễn Thị Minh Phòng Tổ chức Hành chính 07: Quyền Trưởng phòng: Bùi Huy Tưởng 08: Phó trưởng phòng: Trịnh Văn Tiến Bộ môn Kinh tế Tài nguyên Môi trường 09: Phó trưởng Bộ môn: Đinh Hữu Hoàng

10: Phó trưởng Bộ môn: Vũ Kim Mão Bộ môn NC Chiến lược và Chính sách 11: Trưởng Bộ môn: Phạm Bảo Dương 12: Phó trưởng Bô môn: Ngô Văn Hải Bộ môn Hệ thống Nông nghiệp 13: Quyền trưởng bộ môn: Lê Thế Hoàng 14: Phó trưởng Bô môn: Lê Đức Thịnh Bộ môn NC thị trường và Ngành hàng 15: Quyền trưởng Bộ môn: Nguyễn Đình Chính 16: Phó trưởng Bộ môn: Phạm Minh Trí Trung tâm thông tin Phát triển NNNT 17: Quyền giám đốc: Phạm Quang Diệu Trung tâm Phát triển Nông thôn 18: Giám đốc: Vũ Trọng Bình

19: Phó giám đốc Trung tâm: Hoàng Vũ Quang Trung tâm tư vấn chính sách nông nghiệp 20: Phó giám đốc: Nguyễn Ngọc Quế 21: Phó giám đốc: Trần Công Thắng Cơ sở phía Nam 22: Giám đốc:Nguyễn Đỗ Anh Tuấn 23: Phó giám đốc: Nguyễn Mai Oanh